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BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Café.
Data corrente:  28/09/2021
Data da última atualização:  25/04/2023
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  ANGELO, P. C. da S.; ARIYOSHI, C.; CAIXETA, E. T.; PEREIRA, L. F.
Afiliação:  PAULA CRISTINA DA SILVA ANGELO, CNPCa; CAROLINE ARIYOSHI, UEL; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA MOURA, CNPCa; LUIZ FELIPE PEREIRA, UFV.
Título:  Diversity in the regulatory region of genes in the SH3 locus.
Ano de publicação:  2021
Fonte/Imprenta:  In: ASIC CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 28., 2021, Montpellier. Proceedings... Montpellier: ASIC, 2021. p. 227.
Idioma:  Inglês
Notas:  ASIC. S2-P-20.
Conteúdo:  RATIONALE: The SH3 locus is implicated in plant defense against the leaf rust disease caused by the fungi Hemileia vastatrix, which reduces coffee plant production. A cluster of genes coding for NB-LRR proteins is allocated to this locus. Investigating the regulatory region of' these genes can be worthy in knowledge and economically. METHODS: The cis-acting elements (cis-els, conserved motifs for the interaction with transcription machinery) in the promoters (2000 pb up-stream translation start) of 20 genes allocated to paralogous SH3 loci in four coffea spp. genotypes were identified and counted (www.dna.affrc.go.jp/place). Data were analyzed using Sigma Plot. RESULTS: Cis-els more frequently identified are depicted in Fig. 1 (in average, 3.5 times/promoter for SEF4MOTIFGM7S up to 14.1 times for CAATBOXl), Genes diverged for the frequency of cis-els. At least one gene/genotype was found in the highest cis-el frequency class (11.46 < N3, A2, Cl, B8 > 11.9 copies of each cis-el), probably displaying complex patters of induction. Genotypes did not diverge. CONCLUSIONS & PERSPECTIVES: Information presented here are going to be correlated with the transcription level of different genes.
Thesagro:  Genética Vegetal.
Thesaurus Nal:  Coffea; Genotype; Species diversity.
Categoria do assunto:  --
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1134815/1/ASIC-2021.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Café (CNPCa)
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1.Imagem marcado/desmarcadoANGELO, P. C. da S.; ARIYOSHI, C.; CAIXETA, E. T.; PEREIRA, L. F. Diversity in the regulatory region of genes in the SH3 locus. In: ASIC CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 28., 2021, Montpellier. Proceedings... Montpellier: ASIC, 2021. p. 227. ASIC. S2-P-20.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Café.
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2.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA, F. F. de; ARIYOSHI, C.; RAMOS, L. C.; PEREIRA, L. F. P. Validação de marcadores ligados a resistência à ferrugem no cafeeiro (Hemileiavastatrix). In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 9., 2015, Curitiba. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2015.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Café.
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3.Imagem marcado/desmarcadoANGELO, P. C. da S.; ARIYOSHI, C.; CAIXETA, E. T.; PEREIRA, L. F. P.; RIBAS, A. F.; SERA, G. H. Variabilidade no domínio LRR de peptídeos codificados em "clusters" homólogos ao SH3 em diferentes genomas de Coffea. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória, ES. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil. Brasília, DF: Embrapa Café, 2019. Título em inglês: LRR domain variability for peptides encoded in gene clusters homologous to the SH3 in different Coffea genomes.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Café.
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4.Imagem marcado/desmarcadoANGELO, P. C. da S.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, A. G.; PONCE, T. P.; ARIYOSHI, C.; SHIGUEOKA, L. H.; ARANTES, T.; GASPARINI, A. K.; SERA, G. H.; PEREIRA, L. F. P.; CAIXETA, E. T. Could genes allocated to SH3 loci contribute to other resistance factors? In: ASIC CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 29., 2023, Hanoi, Vietnam. Books of abstracts... Montpellier: ASIC, 2023. p. 167. ASIC 2023.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Café.
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5.Imagem marcado/desmarcadoARIYOSHI, C.; SERA, G. H.; RODRIGUES, L. M. R.; CARVALHO, F. G.; SHIGUEOKA, L. H.; MENDONÇA, A. E. S.; PEREIRA, C. T. M.; DESTÉFANO, S. A. L.; PEREIRA, L. F. P. Development and validation of an allele-specific marker for resistance to bacterial halo blight in coffea arabica. Agronomy, v. 12, n. 12, 3178, 2022.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Café.
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6.Imagem marcado/desmarcadoARIYOSHI, C.; SANT'ANA, G. C.; FELICIO, M. S.; SERA, G. H.; NOGUEIRA, L. M.; RODRIGUES, L. M. R.; FERREIRA, R. V.; SILVA, B. S. R. da; RESENDE, M. L. V. de; DESTÉFANO, S. A. L.; DOMINGUES, D. S.; PEREIRA, L. F. P. Genome-wide association study for resistance to Pseudomonas syringae pv. garcae in Coffea arabica. Frontiers in Plant Science, v. 13, article 989847, 2022.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Café.
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